个体工商户给员工发工资缴纳个税的处理，可能会受到一些特殊情况或例外情形的影响：
1. 员工同时有多项收入来源： 如果员工除了从个体工商户处获得的工资薪金所得外，还有劳务报酬所得、稿酬所得等其他综合所得，那么在年度汇算清缴时，需要将各项所得合并计算个人所得税，多退少补。这会影响个体工商户代扣代缴个税的准确性，因为个体工商户仅能就其支付的工资薪金部分代扣代缴，员工其他所得需自行申报或在汇算清缴时处理。
2. 员工享受专项附加扣除： 员工如有子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等专项附加扣除项目，个体工商户在代扣代缴个税时，应根据员工提供的专项附加扣除信息进行税前扣除。若员工未及时提供或信息有误，会导致代扣代缴的个税数额不准确，需要在后续进行调整。
3. 个体工商户采用核定征收方式： 对于一些账证不健全的个体工商户，税务机关可能会采用核定征收方式征收其个人所得税（经营所得）。但这并不影响其作为扣缴义务人，对员工工资薪金所得代扣代缴个人所得税的义务，只是个体工商户自身经营所得的纳税方式有所不同。
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个体工商户给员工发工资缴纳个税的法律依据主要来自《中华人民共和国个人所得税法》。
根据《中华人民共和国个人所得税法》（2018年修正）第二条规定，工资、薪金所得属于应当缴纳个人所得税的范围。同时，该法第九条明确指出，个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。个体工商户作为向员工支付工资薪金的单位，属于法定的扣缴义务人。因此，无论员工工资是否达到起征点，个体工商户都负有代扣代缴（达到起征点时）或申报（未达到起征点时）的义务。这意味着个体工商户给员工发工资时，必须按照上述法律规定，对员工的工资薪金所得进行个人所得税的相关处理。
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个体工商户给员工发工资处理个税时，存在一些常见的错误操作需要避免：
1. 认为工资未达起征点就不申报： 部分个体工商户误以为员工工资未超过5000元就无需进行任何申报，这是错误的。即使无需缴纳税款，也需进行个人所得税明细申报，否则可能被税务机关认定为未履行申报义务。
2. 未按规定代扣代缴： 当员工工资超过起征点时，个体工商户未从员工工资中代扣代缴个人所得税，导致员工个人所得税流失，个体工商户自身也面临未履行扣缴义务的风险。
3. 工资发放记录不完整或不真实： 工资发放记录混乱、缺失关键信息，或者为了少缴个税而虚增或虚减工资数额，这些行为都可能在税务检查时引发问题，甚至被认定为偷税漏税。
为避免因错误操作带来的税务问题，个体工商户在处理员工工资个税事宜时需格外谨慎。如果您对如何正确操作存在困惑，欢迎进一步向律师咨询。
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个体工商户给员工发工资是否需要缴纳个税，答案是肯定的。以下将根据不同情况详细说明：
个体工商户给员工发工资需要申报并代扣代缴个人所得税。
1. 若员工月工资收入超过个人所得税起征点（目前为5000元/月），个体工商户作为支付所得的单位，必须依法为员工代扣代缴个人所得税。
2. 若员工月工资收入未超过5000元，虽然无需缴纳个人所得税，但个体工商户仍需进行个人所得税明细申报，履行申报义务。

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